药学专业学位硕士授予点于2022年获批设立，本学位点由杭州医学院药学院作为主建部门，整合了药学院、附属人民医院药学部、安评中心、实验动物中心等教学和科研力量，拥有药学一流学科B类，2个国家级基地，3个省级重点实验室，1个省医学重点学科群（生物医药重点学科群）和1个省医学创新学科（实验动物基因工程学创新学科），并建有基本符合国际标准的实验动物屏障设施（清洁动物、SPF动物繁育）的实验动物中心和青山湖院区实验动物生产基地。另外，学校建有多个实践教学中心，药学实验室中心，还拥有用于临床试验数据管理和计算机辅助药物设计的软件，用于药代动力学的成都明科宏能数据库，以及用于计算机辅助药物虚拟筛选的多种化合物库。
    药学专业学位硕士授予点，设置有药物合成工艺与制药工程、药物新剂型研发、药物筛选与评价和天然药物研发等多个专业研究方向。本学科主要围绕药学相关的应用研究和药物研究，以实践能力培养为导向，坚持与行业的密切结合，面向药物技术转化、生产、流通、使用等领域，培养具备良好的政治思想素质和职业道德素养、较好掌握药学及相关学科专业知识，具有较强的技术创新能力和解决实际问题能力、符合行业与社会需求的高层次应用型人才。